由于当地没有合适的刑讯条件，李三水等人连夜将这些日本人带回了重庆。

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剩余的十几个日本人将军事情报处在重庆临时办公区的审讯室填的满满的，李三水交待先给所有日本人来一轮鞭刑。

李三水自己则亲自主持审讯那个叫石井的人，同样的，这个石井被赏了一顿鞭子。这个人应该没有受过特工的专业训练，既不能抵抗刑讯，又不能催眠自己进入昏迷。刚刚被抽了几下，就大声哭着说自己要交待，李三水根本不听，还是劈头盖脸的打满了二十鞭子。

李三水放下手里的鞭子，让人给石井泼了一桶盐水，石井惨叫了几声之后，马上快速的喊道：“我叫石井小次郎，日本关东军加茂部队陆军少佐，我要求获得战俘待遇。”

李三水嘴角浮起一丝难以言明的笑容，声音反而十分柔和的说道：“你们加茂部队的人还想要战俘待遇吗？哈哈哈，我这就好好的招待招待你。”接下来，李三水亲自动手，水刑、电刑轮番上阵，石井小次郎终于不再嚷嚷着要什么战俘待遇了。他现在只希望眼前这个人能够给自己一个招供的机会，他会老老实实的说出一切，包括他小时候偷窥叔母洗澡的事情。

根据石井小次郎的供词，他们是受加茂部队长石井四郎少将的指派，秘密潜入重庆，制造生产炭疽病菌，伺机在重庆进行细菌战，希望以此动摇中国军民的抵抗意志和决心。石井小次郎还交待说，有另外一组人和他们同时从华北出发，目的地是武汉，计划在武汉进行同样的细菌战。

李三水听到这个消息，立即暂停了审讯，冲到办公室就给戴春风打电话汇报。戴春风接完电话之后也是浑身直冒冷汗，在此之前，他们根本没有察觉到任何一点风吹草动，根本不知道日本人在武汉要实行如此罪恶的计划。

好在李三水及时发现了日本人的阴谋，戴春风马上命令军事情报处武汉站全力查找这些日本人的下落。

李三水回到审讯室，继续审问石井小次郎。

石井小次郎继续交待说自己是加茂部队长石井四郎的侄子，因为觉得这次是立功的好机会，因此才抢着来重庆的。李三水让他在自己的供词上签字画押，交待人看管好了，不要让人死掉，但是也要让他多遭点罪，不要有严重的外伤就行。

根据石井小次郎等人的交待，李三水相继抓获了潜伏在重庆的日本间谍‘雨蝶’小组和一批被收买的叛徒，彻底解决了这次细菌战的危机。